La federación se constituye en varias áreas o comisiones, que en la actualidad son las siguientes:

Escuela Alavesa de Alta Montaña: Su función es prestar la formación técnica necesaria a los federados.

Deporte Escolar: Organiza salidas y actividades en el marco del deporte escolar.

Medio Ambiente: Analiza y revindica las agresiones que amenazan el entorno natural de la montaña Alavesa, coordinando actividades en su defensa, protección y conocimiento.

Comité de Senderos: Órgano donde se estudia la promoción de nuevos senderos y se analiza la situación actual de los ya existentes.